Činnosť oddelenia podpory samosprávnych orgánov SAV riadi priamo predseda SAV.
Oddelenie vykonáva najmä:
- odborné špecializované činnosti strategického a koncepčného charakteru, odbornú a poradenskú podporu predsedovi akadémie a samosprávnym orgánom akadémie,
- po odbornej stránke zabezpečuje zasadnutia predsedníctva akadémie a vedeckej rady akadémie,
- metodické usmerňovanie a koordinovanie prípravy materiálov na zasadnutia predsedníctva akadémie a vedeckej rady akadémie v súlade s rokovacími poriadkami týchto samosprávnych orgánov,
- evidenciu a kontrolu plnení prijatých uznesení predsedníctva akadémie a vedeckej rady akadémie,
- vypracovávanie zápisníc zo zasadnutí predsedníctva akadémie a vedeckej rady akadémie,
- odbornú podporu pri zasadnutiach snemu akadémie a výboru snemu akadémie,
- kontakt predsedu akadémie s Národnou radou Slovenskej republiky a jej výbormi, s Úradom vlády Slovenskej republiky, s ministerstvami, s ostatnými orgánmi štátnej správy a poradnými orgánmi vlády a so Slovenskou rektorskou konferenciou,
- spoluprácu pri tvorbe koncepčných, analytických a strategických materiálov akadémie,
- plnenie ďalších úloh vyplývajúcich zo všeobecne záväzných právnych predpisov a vnútorných predpisov akadémie,
- ďalšie úlohy podľa pokynov predsedu akadémie.