Sekretariát vedúceho úradu akadémie riadi vedúci úradu akadémie.
Sekretariát zabezpečuje najmä:
- komplexné vedenie agendy vedúceho úradu akadémie,
- prípravu materiálov predkladaných vedúcim úradu do predsedníctva a poradných orgánov SAV,
- vypracovanie a aktualizácia plánu termínov porád a rokovaní vedúceho úradu akadémie,
- vypracovanie zápisníc z porád a rokovaní vedúceho úradu akadémie,
- interný obeh písomných dokladov a dokumentácie voči iným organizačným útvarom úradu akadémie a zamestnancom,
- kontrolu dodržiavania limitov a spracovanie údajov o čerpaní prostriedkov vyčlenených na reprezentačné účely,
- vybavovanie písomností v súlade s platným registratúrnym poriadkom a registratúrnym plánom SAV,
- administratívne a organizačné práce súvisiace s členstvom vedúceho úradu akadémie v komisiách SAV,
- zverejňovanie zmlúv a iných právnych úkonov v Centrálnom registri zmlúv na základe pokynu vedúceho úradu akadémie,
- ďalšie úlohy podľa pokynov vedúceho úradu akadémie.